More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0796 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
240 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.243265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
247 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
261 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18690  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.74 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
238 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  38.6 
 
 
261 aa  121  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.17 
 
 
246 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.41 
 
 
236 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
261 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
241 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.82 
 
 
246 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
258 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  34.62 
 
 
263 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.63 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.6 
 
 
248 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.63 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
261 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34 
 
 
247 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
256 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.05 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
252 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
251 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.74 
 
 
238 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
257 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 
301 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
241 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.89 
 
 
255 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.6 
 
 
258 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
278 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.6 
 
 
258 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
252 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  34 
 
 
248 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
253 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.78 
 
 
255 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 
260 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
256 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
260 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.89 
 
 
247 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.03 
 
 
262 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32 
 
 
250 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.9 
 
 
250 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
275 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.8 
 
 
248 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
254 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.82 
 
 
230 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
284 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.15 
 
 
258 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
246 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.7 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.03 
 
 
258 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
252 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
225 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
254 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
250 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  32.55 
 
 
264 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  34.45 
 
 
260 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.89 
 
 
250 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  26.58 
 
 
258 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
255 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.88 
 
 
246 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.84 
 
 
249 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>