More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17071 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  59.83 
 
 
237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  58.97 
 
 
237 aa  307  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07401  short-chain dehydrogenase/reductase  58.12 
 
 
237 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0585348  normal  0.340687 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1271  putative short-chain dehydrogenase family protein  62.13 
 
 
231 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1213  putative short-chain dehydrogenase family protein  58.3 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06981  short-chain dehydrogenase/reductase  52.34 
 
 
235 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0632  short-chain dehydrogenase/reductase  51.06 
 
 
235 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06881  short-chain dehydrogenase/reductase  50.64 
 
 
235 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06591  short-chain dehydrogenase/reductase  50.21 
 
 
235 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
231 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
241 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
247 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
274 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
266 aa  95.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
516 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.243265  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 
267 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.25 
 
 
241 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
268 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  29.9 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.83 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  31.44 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
347 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18690  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.13 
 
 
244 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  29.53 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.22 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
262 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.38 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  26.67 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.36 
 
 
293 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0596  sepiapterin reductase  27.97 
 
 
243 aa  85.1  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
286 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  31.12 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.23 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  27.68 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.44 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.46 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.44 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
354 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.17 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  25 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  29.54 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.91 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.44 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.05 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>