More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1271 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1271  putative short-chain dehydrogenase family protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1213  putative short-chain dehydrogenase family protein  70.43 
 
 
231 aa  326  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  62.13 
 
 
236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  53.85 
 
 
237 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07401  short-chain dehydrogenase/reductase  54.08 
 
 
237 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0585348  normal  0.340687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  53.85 
 
 
237 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06881  short-chain dehydrogenase/reductase  49.79 
 
 
235 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0632  short-chain dehydrogenase/reductase  48.93 
 
 
235 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06591  short-chain dehydrogenase/reductase  48.93 
 
 
235 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06981  short-chain dehydrogenase/reductase  49.79 
 
 
235 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
238 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
241 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
241 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
247 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
270 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
274 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
258 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
242 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
274 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
254 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
293 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.32 
 
 
247 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
290 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  28.99 
 
 
258 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.71 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.46 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.65 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.39 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.9 
 
 
238 aa  95.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.243265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.05 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.36 
 
 
248 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
246 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
347 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.42 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  31.67 
 
 
259 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
248 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
245 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
263 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.74 
 
 
247 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
283 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
317 aa  91.7  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  30.21 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
262 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  34.36 
 
 
264 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.44 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 
281 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  31.62 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
323 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  30.6 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_5780  predicted protein  35.33 
 
 
194 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.155733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0283  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000106623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>