More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6337 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1271  putative short-chain dehydrogenase family protein  44.35 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1213  putative short-chain dehydrogenase family protein  43.91 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  41.2 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  36.48 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  36.48 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07401  short-chain dehydrogenase/reductase  35.19 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0585348  normal  0.340687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06981  short-chain dehydrogenase/reductase  35.19 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0632  short-chain dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06881  short-chain dehydrogenase/reductase  33.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06591  short-chain dehydrogenase/reductase  33.05 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.82 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  36.82 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.02 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  34.34 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1800  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0532  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2477  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2905  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.901799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2790  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2851  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.9 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 		 267 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.75 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.86 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.86 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 267 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.61 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  28.94 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.26 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 282 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.64 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.77 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.57 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.77 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.77 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.95 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.66 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0459105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>