More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1213 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1213  putative short-chain dehydrogenase family protein  100 
 
 		 231 aa  476  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1271  putative short-chain dehydrogenase family protein  70.43 
 
 		 231 aa  333  1e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  58.3 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  56.22 
 
 		 237 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  55.36 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07401  short-chain dehydrogenase/reductase  50.64 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0585348  normal  0.340687 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0632  short-chain dehydrogenase/reductase  48.5 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06881  short-chain dehydrogenase/reductase  48.07 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06591  short-chain dehydrogenase/reductase  48.5 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06981  short-chain dehydrogenase/reductase  47.64 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  33.19 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  29.49 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.13 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.56 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  33.51 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  31.44 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.74 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.84 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  28.39 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0748  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.9 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  26.75 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  28.38 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  28.45 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.33 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  29.22 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 267 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.243265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.21 
 
 		 260 aa  88.2  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.83 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  28.36 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  28.09 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.04 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.46 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  31.2 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.22 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.89 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>