More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0417 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  43.18 
 
 
265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  43.18 
 
 
265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  43.18 
 
 
265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
263 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  39 
 
 
267 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
256 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
256 aa  161  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
256 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
254 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
253 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
269 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
252 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 
266 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
253 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
286 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
253 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 
287 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 
287 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 
287 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
292 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
247 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 
254 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
278 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
277 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  32.18 
 
 
260 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
251 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
254 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
251 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
247 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
262 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
260 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06981  short-chain dehydrogenase/reductase  30.49 
 
 
235 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3899  hypothetical protein  28.08 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.363357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.46 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  30.69 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.7 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  31.05 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.3 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>