More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1328 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0340631  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 340 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0888  ketoacyl reductase  42.55 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00330  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.67 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 282 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 		 257 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.67 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 275 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  34.92 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  35.08 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 290 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 227 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  33.21 
 
 		 544 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.94 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  30.61 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>