More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0140 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.62 
 
 
261 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.77 
 
 
260 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
264 aa  354  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.14 
 
 
258 aa  313  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  47.08 
 
 
275 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
275 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
291 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
264 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
271 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.53 
 
 
258 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
262 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
262 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
262 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
259 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
263 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
271 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
269 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
257 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
262 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
256 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
263 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
269 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
263 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
263 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  40.87 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
260 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
262 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
263 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
286 aa  178  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
257 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.92 
 
 
266 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
265 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.15 
 
 
266 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.28 
 
 
258 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
257 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
259 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  37.86 
 
 
258 aa  175  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
258 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
259 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
257 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
360 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
277 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
260 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
258 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.22 
 
 
257 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
344 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
292 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  35.95 
 
 
259 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
258 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  41.87 
 
 
264 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  38.42 
 
 
261 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  35.95 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
262 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  38.34 
 
 
266 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.82 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
266 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.07 
 
 
259 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
266 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
261 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
255 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
258 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
267 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
283 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
276 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
264 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
256 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
259 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
281 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
267 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
284 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
266 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
265 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
281 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>