More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4423 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.34 
 
 
265 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  47.62 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
263 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
289 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
260 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
262 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
260 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
259 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 
257 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
259 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.94 
 
 
257 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
256 aa  175  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  36.76 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  35.97 
 
 
259 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
261 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
261 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
264 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
261 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
266 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
256 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
265 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.83 
 
 
258 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
267 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
262 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.76 
 
 
261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  42.06 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
259 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
259 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
259 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
263 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
264 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.34 
 
 
266 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.86 
 
 
267 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
291 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
258 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
260 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
266 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
257 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
262 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
261 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
269 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
272 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38 
 
 
275 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
257 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
256 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.8 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
258 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  35.18 
 
 
258 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
275 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
267 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
257 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
255 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
262 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  38.16 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
344 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
277 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
258 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
286 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
273 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
255 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
284 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
262 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
262 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
258 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  34.66 
 
 
261 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.45 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>