More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0746 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0746  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.33 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 292 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.8 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25.3 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  28.38 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  26.18 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 450 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2316  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.2 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.93 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  28.12 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.34 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>