154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0971 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 138 aa  282  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  60.9 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  54.68 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  55.3 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  55.22 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  53.28 
 
 		 156 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  55.56 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  36.64 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  35.11 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  35.2 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  37.82 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  39.18 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  36.8 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  39.18 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  29.53 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  30.88 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  31.15 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  28.68 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.23 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  26.56 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  26.89 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.34 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.57 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  28.26 
 
 		 159 aa  57  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  26.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  32.87 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  27.56 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  29.13 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  29.59 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  28.23 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  28.09 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  23.39 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  28.35 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  23.02 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  24.41 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  29.09 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  29.09 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.97 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  32.67 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0705  hypothetical protein  27.34 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.276806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  29.29 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  27.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34.31 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  34.51 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  28 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  24.26 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.43 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  25.66 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  23.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  25.66 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  27.13 
 
 		 167 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.19 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.43 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  30.49 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  28.97 
 
 		 202 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  31.46 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  29.13 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.19 
 
 		 258 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  31.07 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  23.36 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  29.81 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  26.21 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  23.33 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  26.87 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  26.47 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.19 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.19 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.19 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  27.18 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  27.4 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  24.03 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  27.27 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  27.55 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  24 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  27.55 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  24.48 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  28.26 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.26 
 
 		 274 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  28.16 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.09 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  23.02 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  30.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  30.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>