More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1283 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  91.33 
 
 
150 aa  275  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  48.44 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  41.3 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.94 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  36.61 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  32.56 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.16 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.54 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  40.74 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  31.06 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  34.38 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  34.85 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  33.83 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.83 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  34.88 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  32 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  41.41 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  30.91 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.86 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  30.88 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  35.59 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  35 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  29.45 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  40.59 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  36.84 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  39 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  29.45 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  40.21 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  38.3 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  33.33 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  35.25 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  34.23 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  37.08 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.51 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  33.62 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  33.04 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  38.3 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  38.14 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.27 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  38.3 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  32.35 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  38.3 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  38.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  38.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  36.97 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  38.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  38.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  30.89 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  34.68 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  43.18 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.02 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.19 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.27 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  36.9 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  41.57 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  36.63 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  29.09 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  30.17 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  28.28 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  30.7 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.11 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  33.33 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.89 
 
 
258 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1509  hypothetical protein  38.46 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  38.3 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.11 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  31.82 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.31 
 
 
255 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  31.11 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  34.95 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  31.15 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.08 
 
 
258 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33 
 
 
193 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.08 
 
 
258 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.08 
 
 
258 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  32.35 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  30.17 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  35.48 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  35.11 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>