More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3781 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  82.12 
 
 		 162 aa  247  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  83.44 
 
 		 157 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  82.12 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  82.12 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  78.15 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  78.15 
 
 		 166 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  80.79 
 
 		 164 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  77.48 
 
 		 168 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  82.12 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  76.82 
 
 		 160 aa  224  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  61.22 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  59.18 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  58.78 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  59.18 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  58.27 
 
 		 161 aa  169  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  58.82 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  56.67 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  55.78 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  58.67 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  57.53 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  56 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  55.4 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  55.4 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  58.5 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  56.16 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  53.95 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  57.14 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  53.02 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  57.43 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  59.86 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  55.97 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  56.67 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  52.63 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  54.97 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  56 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  51.32 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  56 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  56 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  56 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  56 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  59.18 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  58.5 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  55.1 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  50.62 
 
 		 160 aa  149  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  58.5 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  56.67 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  56.49 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  50.66 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  57.82 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  58.5 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  61.67 
 
 		 274 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  56.95 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  49.36 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  56.95 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  56.95 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  56.95 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  57.14 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  56 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  51.37 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  54.81 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  49.69 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  56.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  50.67 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  50.67 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.33 
 
 		 245 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  49.03 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  53.29 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.59 
 
 		 255 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.07 
 
 		 258 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.59 
 
 		 261 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.59 
 
 		 261 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 273 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 270 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.85 
 
 		 437 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 258 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 258 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 258 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  47.4 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  47.68 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  47.68 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  55.88 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>