More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0450 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  78.49 
 
 		 195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  80.23 
 
 		 195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  71.01 
 
 		 190 aa  240  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  70.41 
 
 		 190 aa  235  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  75.6 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  66.27 
 
 		 169 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  56.21 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  56.21 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  53.95 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  50.93 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  50.65 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  49.06 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  49.69 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  65.52 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  54.55 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  48.39 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  52.38 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  53.9 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  41.72 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  49.37 
 
 		 185 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  57.98 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  45 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  57.14 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  49.67 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  51.24 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  53.78 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  43.98 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  52.89 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  46.41 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  52.03 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  49.65 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  42.95 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  44.08 
 
 		 202 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  49.15 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.75 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52.1 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  51.22 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  48.74 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  50.83 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  48.74 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  46.22 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  43.36 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  51.26 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  50.42 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  43.88 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  53.85 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  45.76 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  45.76 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  46.61 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  42.55 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45.76 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  47.06 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  47.37 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  45.22 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  37.75 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  45.3 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  54.1 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.14 
 
 		 258 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  38.97 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.14 
 
 		 258 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.14 
 
 		 258 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.28 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.13 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  47.1 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 261 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 261 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  45.76 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.71 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  38.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  39.26 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.28 
 
 		 255 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.52 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  41.1 
 
 		 160 aa  101  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  40 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 301 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  42.96 
 
 		 189 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>