296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0577 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  43.22 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  39.84 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  36.52 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.92 
 
 		 446 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  40.15 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  34.35 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  29.03 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  32.17 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  38.64 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  32.32 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  29.84 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.17 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  33.33 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  34.13 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  30.89 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  35.16 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.74 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  33.59 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  33.33 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  38.61 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  31.43 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.68 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  32.28 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  32.08 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  41.05 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  37.74 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  30.11 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  36.45 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  31.18 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  25.86 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.21 
 
 		 273 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.21 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.95 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.95 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  34.02 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.95 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.61 
 
 		 437 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.95 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.95 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  24.14 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  31.78 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  23.36 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.7 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  28.68 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.79 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.59 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  29.27 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.76 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  26.85 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  34.88 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  32.97 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  23.49 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  34.88 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.59 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  34.88 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  27.07 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.79 
 
 		 237 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  28.77 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  28.92 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  27.66 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  26.42 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  23.28 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  25.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  35.16 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  26.27 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  25.64 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  32.29 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  26.42 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  28.85 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  27.87 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.72 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.72 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  29.63 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.72 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  27.42 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  23.89 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  24.32 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  30.4 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>