More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0729 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  61.31 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  61.94 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  61.76 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  54.26 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0449  putative metalloprotease  53.68 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  51.45 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  51.52 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  51.11 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  48.03 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  39.84 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  39.81 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.72 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 301 aa  84.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  33.81 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  41.38 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.95 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.56 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.6 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  34.07 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  39.62 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.44 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  33.64 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  38.39 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  30.72 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  34.35 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  34.13 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  31.9 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  30.53 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  67  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  37.25 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  36.21 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.6 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  30.83 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  35.64 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  31.16 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  31.73 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  40.23 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  31.15 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  36.28 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  32.84 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  34.41 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  32.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  42.53 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  31.67 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  31.67 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  37.39 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.3 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.37 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  31.03 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  30.65 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  30.65 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  45.57 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  31.86 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  33.63 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  31.21 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  32.08 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  36.26 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  33.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  35.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  32.69 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  34.07 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.58 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  29.77 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  35.24 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  36.46 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  37.89 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  39.02 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  28.83 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  37.63 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  37.89 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  30.17 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>