More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2275 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  98.21 
 
 		 168 aa  331  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  50.91 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  47.31 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  43.71 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  40.61 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  42.42 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  44.85 
 
 		 446 aa  124  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.58 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.65 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  43.14 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40.24 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  38.92 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.87 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.87 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  39.16 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  38.55 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.35 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.16 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  42.41 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  37.35 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  43.05 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  35.98 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  36.97 
 
 		 301 aa  98.2  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36.6 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.37 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  34.46 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.27 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.97 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  33.13 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  35.37 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  37.8 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  30.72 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  37.01 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  35.34 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  31.71 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.96 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  36.64 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  31.25 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  37.19 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.11 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  36.72 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  34.93 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  34.88 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  34.48 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  34.07 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.32 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  34.67 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  33.85 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.55 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  34.38 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  31.29 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  36.22 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  29.46 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  38.94 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.94 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  35.94 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  33.1 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf636  hypothetical protein  34.17 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  32.12 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  34.38 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  31.39 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  29.1 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  31.95 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  32.9 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  35.61 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  32.33 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  32.5 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  35.46 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  32.43 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  30.25 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  33.08 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  26.22 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  34.51 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  31.91 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  32.85 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>