More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2305 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
172 aa  338  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  44.83 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.69 
 
 
156 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  40.56 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  45.7 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  43.65 
 
 
147 aa  94  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  39.42 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  46.43 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.62 
 
 
142 aa  90.9  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42.96 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.22 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45.3 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.77 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.48 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  45.67 
 
 
149 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  41.06 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  40.74 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  34.18 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.25 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  47.06 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.34 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  30.86 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.15 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.86 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.09 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  37.97 
 
 
301 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  37.32 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  39.46 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  40.48 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  33.11 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  33.33 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.22 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  38.98 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  40.17 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  36.62 
 
 
132 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.35 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  32.52 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  38.69 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  35.61 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  37.5 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  30.13 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  32.45 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  40.29 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  39.32 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  38.98 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40.16 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  46.23 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  41.94 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  31.5 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  38.21 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  36.64 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  43.8 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  36.75 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  30.13 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  40.48 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  32.7 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  41.09 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  35.19 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  39.23 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  38.46 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  35.9 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  39.23 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  32.93 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.97 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  37.04 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.3 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  39.32 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  40.48 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  39.86 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  39.5 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.71 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  31.13 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.71 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  39.32 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  39.32 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  31.76 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  42.99 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  34.21 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  39.32 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  39.32 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  39.32 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  36.75 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  37.61 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  30.95 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  36.44 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>