More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1028 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  67.63 
 
 
159 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  66.91 
 
 
160 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  47.31 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  46.67 
 
 
154 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  43.26 
 
 
159 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  52.59 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  43.8 
 
 
156 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.88 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  44.12 
 
 
156 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  51.72 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  44.67 
 
 
446 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  41.61 
 
 
156 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  40.88 
 
 
156 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 
153 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  41.04 
 
 
156 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  41.04 
 
 
156 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  41.22 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.8 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  44.8 
 
 
180 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.53 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  40.85 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  40.88 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  34.87 
 
 
158 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  39.72 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  36.62 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  37.6 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.14 
 
 
301 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  38.85 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  34.59 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  34.97 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.3 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  36.73 
 
 
172 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  42.74 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  33.33 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  40.16 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  42.73 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.88 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  38.62 
 
 
178 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.37 
 
 
168 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  42.37 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  41.03 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  35.14 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.31 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  35.37 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  41.61 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  37.21 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  42.98 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.51 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  43.1 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.88 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  41.67 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  39.66 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  39.82 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  33.81 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.98 
 
 
168 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  37.68 
 
 
195 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  39.01 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.69 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  42.02 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  42.02 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10360  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.61 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000182754  unclonable  0.000000000997482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  41.88 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  40.68 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  39.75 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  41.18 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  39.26 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  40.71 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  43.16 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.68 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  35.98 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  38.06 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.72 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  36.44 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  41.38 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  38.21 
 
 
176 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.28 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.18 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  46.74 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  39.47 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  41.6 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  39.55 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  30.2 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  39.55 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  36.52 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  38.06 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  41.73 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  36.75 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  40.71 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>