More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3921 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  330  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  58.75 
 
 
162 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  54.55 
 
 
195 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  55.48 
 
 
190 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  57.72 
 
 
158 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  57.72 
 
 
158 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  54.79 
 
 
190 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  55.17 
 
 
168 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  53.9 
 
 
195 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  45.45 
 
 
158 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  59.03 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  51.22 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  52.17 
 
 
169 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  50.96 
 
 
159 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  47.17 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  49.36 
 
 
161 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  48.72 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  46.58 
 
 
171 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  44.85 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  48.08 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  54.24 
 
 
176 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  46.01 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  45.73 
 
 
181 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  51.88 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  53.33 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  45.16 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  53.33 
 
 
167 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.4 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  47.62 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  45.86 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  48.92 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  44.97 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  44.72 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  49.6 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  43.87 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  45.16 
 
 
169 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  50.41 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  42.07 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  50 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  43.59 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  49.14 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  43.59 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.14 
 
 
154 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  42.68 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  44.8 
 
 
158 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  50 
 
 
161 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  39.07 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  54.78 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  49.14 
 
 
154 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  46.83 
 
 
154 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.33 
 
 
274 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  43.94 
 
 
202 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  47.41 
 
 
157 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  45.3 
 
 
158 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  47.41 
 
 
157 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  47.41 
 
 
157 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  47.41 
 
 
157 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  52.78 
 
 
159 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  44.76 
 
 
162 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  48.28 
 
 
157 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  38.16 
 
 
158 aa  104  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  46.79 
 
 
166 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  48.28 
 
 
161 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  40.37 
 
 
168 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  44.92 
 
 
157 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  39.49 
 
 
155 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  46.55 
 
 
157 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  47.41 
 
 
154 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  41.29 
 
 
160 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  46.46 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  46.9 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.37 
 
 
245 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  42.75 
 
 
156 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  44.83 
 
 
153 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  39.22 
 
 
165 aa  101  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.22 
 
 
158 aa  101  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  37.34 
 
 
155 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  46.81 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.4 
 
 
258 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.21 
 
 
258 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.4 
 
 
258 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  38 
 
 
152 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.4 
 
 
258 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.09 
 
 
270 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  42.65 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.32 
 
 
270 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  49.14 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  49.14 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.91 
 
 
237 aa  98.2  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.09 
 
 
255 aa  97.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  48.28 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  41.94 
 
 
153 aa  97.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  48.28 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>