More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0233 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 159 aa  314  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  86.79 
 
 		 159 aa  244  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  74.68 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  73.42 
 
 		 161 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  72.78 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  72.96 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  54.43 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  61.02 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  54.84 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  52.59 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  48.72 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  47.5 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  59.48 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  59.48 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  45.68 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  46.88 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  47.13 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  56.41 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  54.31 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  46.41 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  47.2 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  44.79 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  48.87 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  43.75 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  49.36 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  52.63 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  54.24 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  45.18 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  48.76 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.93 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  44.91 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  52.68 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  46.54 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  44.03 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  41.4 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  46.05 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  47.93 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  50 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  44.85 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  44.36 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  51.67 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  44.08 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  49.12 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  49.11 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  42.76 
 
 		 202 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  49.14 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  40.94 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  49.18 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  46.43 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  49.12 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  47.32 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  47.32 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  47.54 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.85 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  51.28 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  41.61 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  48.59 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  52.63 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  46.02 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  50.43 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.52 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  49.56 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  46.96 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  41.38 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  48.95 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  43.1 
 
 		 206 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  49.18 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  44.29 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  43.14 
 
 		 171 aa  97.1  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  48.72 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  47.32 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  47.32 
 
 		 205 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  50.5 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  42.75 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  39.26 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  52.1 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.04 
 
 		 261 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.04 
 
 		 261 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0249  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>