More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1151 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  91.25 
 
 		 160 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  91.88 
 
 		 172 aa  297  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  38.67 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.16 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  36.62 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.15 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.25 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  43.93 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.84 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.77 
 
 		 446 aa  87.8  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.13 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.09 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.44 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40 
 
 		 301 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  41.09 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  37.41 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  37.41 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  37.41 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  37.67 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  41.13 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  40.5 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  38.97 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  34.09 
 
 		 153 aa  84  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.29 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  46.15 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  33.78 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.33 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  35.2 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  40.16 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  36.05 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  37.76 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  37.88 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  39.6 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  35.11 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  34.27 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  36.94 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  39.62 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  38.97 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  32.87 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  36.7 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  34.03 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  33.57 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  36.92 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  32.87 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  37.01 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  36.61 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  37.69 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  37.61 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  38.02 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.12 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  32.12 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  32.39 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  31.65 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  31.58 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  35.11 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  36.89 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  33.8 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  32.84 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.95 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  38.33 
 
 		 411 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  37.3 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  40 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.58 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  37 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  32.91 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  41 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  38.41 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  34.59 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  39.09 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  32.52 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  35.78 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  41.84 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  40.87 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  38.02 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  35.56 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  40 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>