More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0863 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  72.73 
 
 		 182 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  59.33 
 
 		 151 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  60.67 
 
 		 153 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  59.48 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  58.67 
 
 		 150 aa  178  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  52.47 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  58 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.63 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  54.42 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  49.03 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  53.15 
 
 		 155 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  52.7 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  51.9 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  48.8 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  50.32 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  50 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  50 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  50 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  50.34 
 
 		 178 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  48.65 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  52.05 
 
 		 157 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  51.37 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  48.67 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  50.98 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  44.24 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  47.44 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  42.22 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  46.15 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  47.1 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  45.39 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  44.87 
 
 		 170 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  51.72 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  47.33 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  47.97 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  44.67 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  43.79 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  47.89 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  36.77 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  41.53 
 
 		 446 aa  98.2  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.48 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.23 
 
 		 155 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.23 
 
 		 155 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.12 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  35.71 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  43.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  47.37 
 
 		 142 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  91.3  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.01 
 
 		 152 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.06 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  36.09 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  32.24 
 
 		 159 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  39.42 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  36.51 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.42 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 135 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  37.88 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  32.62 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  39.25 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  33.79 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  34.88 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.85 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  38.18 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  40.78 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  38.32 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  33.56 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.52 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.94 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.94 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  34.91 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.59 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.14 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  34.91 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.33 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  32.33 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  29.45 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  31.79 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  37.38 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  35.09 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.38 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  34.59 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  33.96 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>