More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3452 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  93.59 
 
 		 170 aa  296  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  67.95 
 
 		 156 aa  216  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  67.53 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  66.45 
 
 		 183 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  61.54 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  59.63 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  60.51 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  61.01 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  61.94 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  60.13 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  61.59 
 
 		 177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  61.59 
 
 		 177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  61.59 
 
 		 177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  57.79 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  59.6 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  58.94 
 
 		 178 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  58.23 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  57.52 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  56.05 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  57.69 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  58.06 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  55.28 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  57.69 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  57.42 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  60.93 
 
 		 182 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  54.78 
 
 		 188 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  55.35 
 
 		 201 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  57.42 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  51.92 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  60.26 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  46.15 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  50.32 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  47.74 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  47.1 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.02 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  42.28 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  39.75 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  36.88 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.32 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.32 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.03 
 
 		 446 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  42.62 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.8 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  45.53 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.58 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  46.9 
 
 		 301 aa  90.5  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.98 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.4 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  42.67 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  39.6 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  39.6 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.2 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.15 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  43.22 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  42.15 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  43.22 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.46 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  48.11 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  34.3 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.37 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  34.44 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.79 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  38.27 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  37.82 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  39.84 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  46.09 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  41.59 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  38.79 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  38.6 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  41.74 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  29.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.9 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  43.12 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  31.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  34.67 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  32.31 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  36.84 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.74 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  34.67 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  33.75 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  36.44 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.62 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  43.27 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  37.72 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  31.97 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  28.97 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>