More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2231 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  100 
 
 
157 aa  317  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  88.54 
 
 
157 aa  290  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  66.44 
 
 
153 aa  201  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  63.01 
 
 
150 aa  192  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  65.77 
 
 
153 aa  190  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  62.33 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  61.84 
 
 
162 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  62.33 
 
 
151 aa  184  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  67.12 
 
 
150 aa  183  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  64.05 
 
 
160 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  58.67 
 
 
153 aa  181  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  58.33 
 
 
159 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  60.53 
 
 
164 aa  176  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  57.24 
 
 
178 aa  176  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  57.24 
 
 
177 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  57.24 
 
 
177 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  57.24 
 
 
177 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  61.84 
 
 
156 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  56.58 
 
 
184 aa  173  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  55.56 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  59.73 
 
 
156 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  57.43 
 
 
183 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  55.03 
 
 
149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  57.89 
 
 
182 aa  163  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  60.81 
 
 
186 aa  163  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  52.23 
 
 
167 aa  163  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  53.16 
 
 
187 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  50.32 
 
 
166 aa  153  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  52.05 
 
 
186 aa  151  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  49.33 
 
 
156 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 
188 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  51.33 
 
 
159 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.23 
 
 
157 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  50 
 
 
201 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  50 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  49.67 
 
 
170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  50.33 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  57.24 
 
 
179 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.88 
 
 
155 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  43.64 
 
 
446 aa  92  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  34.87 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  34.87 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.3 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.62 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.77 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.61 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  32.43 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  34.01 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  32.89 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  37.12 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.07 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.98 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.78 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  34.23 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  36.23 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.9 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  32.05 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  34.21 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  37.27 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  34.97 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  41.07 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  35.66 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  32.3 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.26 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  36.94 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  36.52 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  38.79 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  37.84 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  32.41 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  32.41 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  36.44 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  32.48 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1067  protein of unknown function UPF0054  36.76 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.72 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.33 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  38.18 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  38.18 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  33.55 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  36.5 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  34.53 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  34.97 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  38.52 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  34.97 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  38.95 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  32.73 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  34.97 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  34.97 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>