More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  57.05 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  53.33 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  54.36 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  61.07 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 184 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  55.7 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  56.08 
 
 		 149 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  53.42 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  52.12 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  54.61 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  52.23 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.02 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  54.05 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  53.33 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  50.32 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  50.98 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  48.8 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  51.37 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  51.02 
 
 		 162 aa  151  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  56 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  53.21 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  51.01 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  46.99 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  57.33 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  50.32 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  51.66 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  48.7 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  47.53 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  48 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  54.61 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  54.42 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  45.32 
 
 		 201 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  43.2 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  43.2 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  40.32 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  43.52 
 
 		 446 aa  95.5  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  41.54 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  39.68 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  38.98 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.95 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  42.4 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  39.31 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  41.94 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  40.8 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  36.03 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.13 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  35.25 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  42.34 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  40.35 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.09 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  34.38 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  39.29 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.79 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.5 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.95 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  37.72 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.12 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  40.18 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  37.27 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  42.61 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.39 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.39 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  39.09 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  38.39 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  35.16 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  30.37 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  37.58 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  39.25 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  37.96 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  37.39 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  37.17 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  40 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  36.04 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  38.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>