More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1242 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.32 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  40.52 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  39.26 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  36.92 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  34.13 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.9 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  39.81 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  35.71 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  42.39 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  40.54 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  40.54 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  41.82 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  36.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.07 
 
 		 446 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  44.94 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  33.07 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  38.74 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  30.2 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.5 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  31.97 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  39.66 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  40.52 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  37.69 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  39.62 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.29 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  27.78 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  35.61 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.39 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  36.92 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  33.57 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  33.1 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  37.14 
 
 		 187 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  38.33 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  33.58 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.04 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  34.26 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  37.96 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  35.04 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  36.22 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  37.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  37.27 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  34.51 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  40.35 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  39.56 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  34.06 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.78 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  30.94 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  36.19 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  34.51 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  39.25 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  31.06 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  36.04 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  37.14 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  38.2 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  34.78 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  34.86 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  32.64 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  39.29 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  32.8 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  31.39 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  32.89 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  38.2 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.45 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.65 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  39.29 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  28.46 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  35.78 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  27.14 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 177 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 177 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 177 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  28.1 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  32.2 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  32.77 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  36.89 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  32.77 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  34.78 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>