286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03360 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  68.35 
 
 
139 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  56.52 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  48.91 
 
 
146 aa  136  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  50.38 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  49.63 
 
 
143 aa  131  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  43.38 
 
 
151 aa  130  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  44.72 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  42.2 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  33.83 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  36.52 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  33.86 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  33.86 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  39.81 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  35.9 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.84 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.89 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  29.6 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  29.6 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  30.58 
 
 
301 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  32.43 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  29.09 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  34.35 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  32.69 
 
 
411 aa  67.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  32.68 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  30.46 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  33.91 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  31.48 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.65 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.08 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  35.79 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  28.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.91 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.71 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  34.21 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  36.52 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  33.02 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  35.11 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  33.87 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  29.36 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  35.11 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  34.74 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.41 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  31.58 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  27.71 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  31.07 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  29.59 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  30.33 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  29.73 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  33.04 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  33.04 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  30.09 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  38.46 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  29.37 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  26.45 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  27.68 
 
 
202 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  28.7 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  31.68 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  33.04 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  32.71 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  29.63 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  32.29 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  29.51 
 
 
446 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  30.58 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  34.15 
 
 
205 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  24.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  24.63 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  35.09 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.33 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  28.97 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  28.43 
 
 
114 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  28.97 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  33.62 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  29.84 
 
 
165 aa  52.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  32.74 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  32.74 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  31.11 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  25.76 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  26.5 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  28.46 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  28.81 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>