220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0007 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 142 aa  294  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  49.26 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  50.36 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  46.62 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  44.12 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  45.8 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  44.27 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  42.75 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  36.64 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  34.65 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  39.13 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  36.52 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  33.64 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  33.91 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  41.46 
 
 		 411 aa  64.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.81 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  32.06 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.98 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  31.48 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  40.51 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  31.25 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  37.25 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  40.51 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  35.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  26.77 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  34.51 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  31 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  28.57 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  26.76 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  30.84 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  36.17 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  32.54 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  32.94 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  25.98 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.07 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  26.9 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  28.78 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.02 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  29.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  32.14 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  31.45 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35.16 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  26.89 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  32.35 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.16 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  31.13 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  28.07 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  30.49 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.07 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.77 
 
 		 255 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  37.65 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  37.65 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  26.5 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  32.14 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  26.72 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  31.54 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  25.76 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  30.11 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  26.83 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  29.82 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  28.44 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  30.12 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  25.95 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  30.19 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  28.97 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  27.86 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  27.91 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  29.46 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  31.82 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  29.89 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  30.77 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  30.56 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.89 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  28.85 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  31.78 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>