194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3501 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  293  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  59.7 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  50.37 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  50.36 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  49.63 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  42.96 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  44.7 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  47.01 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  43.28 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  41.04 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  37.61 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  36.94 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  35.24 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  32.14 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  35.45 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  32.17 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.63 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  39.56 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  33.67 
 
 		 411 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.48 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  34.62 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.57 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  26.45 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  29.52 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  32.39 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35.43 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  24.8 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  30.93 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  28 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  30.72 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  27.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  26.27 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  34.31 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  31.53 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  30.39 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  33.65 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  26.83 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.78 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  30.4 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  29.27 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  28.18 
 
 		 301 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  31.13 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  34.02 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  30.21 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  33.65 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  28.15 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  26.4 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  25.22 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  28.45 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  31.37 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.34 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  27.03 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  26.72 
 
 		 158 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  26.13 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  25.93 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  30.17 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  28.23 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  30 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  30.69 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  32.99 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  33.65 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  26.02 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  30.71 
 
 		 446 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  35.48 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.88 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  32.65 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.17 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  26.83 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  27.82 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  30.49 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  26.13 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2519  hypothetical protein  30.48 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0705  hypothetical protein  32.38 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.276806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  27.13 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  25.51 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  27.66 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  25.89 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.86 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  25.86 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  27.1 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>