More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2732 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
128 aa  263  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  69.17 
 
 
129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  68.85 
 
 
150 aa  167  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  67.77 
 
 
127 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  68.42 
 
 
114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  67.21 
 
 
132 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  66.39 
 
 
132 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  59.79 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  54.62 
 
 
150 aa  103  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  47.27 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  45.3 
 
 
156 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  46.85 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  39.67 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  40.52 
 
 
446 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  42.62 
 
 
162 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.44 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.21 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  48 
 
 
193 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.44 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  43.09 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  43.09 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.89 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  45.95 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.74 
 
 
301 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  39.52 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  39.29 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  45.26 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  39.53 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  37.12 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.16 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  46.09 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  39.32 
 
 
195 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  40.57 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.5 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  41.58 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  40.65 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  41.41 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  38.52 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.72 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  42.74 
 
 
411 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.35 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.21 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  39.45 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.66 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  36.75 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  39.34 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  41.11 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  42.34 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  37.72 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  41.51 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  39.81 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  36.79 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  40.86 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  39.42 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  35.77 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  40.45 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  44.04 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  40.62 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  40.43 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  38.53 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.89 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  33.94 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  35.77 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  35.78 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  39.06 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  38.68 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  38.74 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  47.78 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  40.37 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  43.82 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  38.89 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  46.15 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.87 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  36.73 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  41.67 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  38.32 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  39.18 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  43.12 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  39.36 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  36.59 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  37.14 
 
 
168 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  35.19 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>