More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1273 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  306  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  62.18 
 
 		 140 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  55 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  52.08 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  51.61 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  42.19 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.36 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  46.46 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.35 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  53.19 
 
 		 301 aa  84.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.87 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  34.38 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  48.35 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  43.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  48.96 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  47.78 
 
 		 446 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.59 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.87 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.65 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  45.56 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  46.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  38.53 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  36.15 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  39.81 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  44.9 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  47.31 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  38.38 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  34.75 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  40.22 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.65 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  42.27 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.21 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  40.86 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  41.49 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  42.55 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  45.05 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.47 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  42.39 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  42 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.54 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.36 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  39.22 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  45.05 
 
 		 411 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.84 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  38.78 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  41 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  37.62 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  43.33 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  41 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2711  hypothetical protein  60 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  41.84 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  31.58 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.14 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  37.78 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.65 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  43.62 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  37.84 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.58 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  41.94 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  36.96 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  39.64 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  36.96 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  36.96 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  36.94 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  29.55 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  42.53 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  38.14 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  35.48 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  33.64 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  41.35 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.22 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  40.19 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  38.32 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  39.13 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  45.45 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  36.73 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  45.26 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  33.64 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>