More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0477 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  63.64 
 
 
145 aa  179  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0449  putative metalloprotease  63.64 
 
 
135 aa  176  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  60.29 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  58.78 
 
 
135 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  58.78 
 
 
135 aa  153  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  55.88 
 
 
140 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  58.02 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  51.52 
 
 
137 aa  134  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  53.28 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  44.64 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.18 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  38.46 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 
446 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  43.48 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.5 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  39.85 
 
 
156 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  39.66 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  38.17 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  37.88 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  37.06 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.59 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.38 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.4 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.94 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  38.98 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  38.98 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  39.67 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  34.71 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.85 
 
 
168 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  34.75 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  36.7 
 
 
411 aa  76.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.11 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  37.17 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  38.98 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  35.34 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  30.67 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  36.64 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  36.04 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  36.45 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  42.39 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.17 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  36.15 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  38.32 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  40.37 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  39.8 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  38.95 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  33.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  40.2 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  34.19 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  37.61 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  37.61 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  35.9 
 
 
157 aa  67  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  36.94 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.11 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  26.21 
 
 
178 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  38.54 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  31.45 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  33.9 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  36.45 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  39.18 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  37.63 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  34.82 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  33.05 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  33.05 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  37.86 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  34.86 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  33.86 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  32.76 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  32.35 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  35.96 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  38.83 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  34.65 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  31.62 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  34.58 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  34.56 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  34.74 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  35.65 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  33.82 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  34.55 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  34.58 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf636  hypothetical protein  34.15 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  35.92 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  36.96 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>