More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0237 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 146 aa  292  9e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 301 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  36 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  36.8 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  35.34 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  33.09 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  35.54 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  44.09 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  30.23 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  44.86 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  33.62 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  32.52 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  30.94 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  39.47 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  39.47 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.71 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.2 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.51 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.45 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  41.24 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  40.5 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  32.48 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  41.75 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  28.68 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.5 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  32.43 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  32.35 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  37.4 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  38.18 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  38.05 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  38.05 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  40.21 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  37.96 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  32.37 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  38.74 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  35.96 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  37.04 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.96 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.37 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  39.53 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  36.11 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  36.11 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.88 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  35.88 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  39.29 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  39 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  33.09 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  38.02 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  35.65 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  35.51 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  41.07 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  35.92 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.04 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  37.27 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  41.46 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  32.52 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  36.79 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  36.52 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  33.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  33.04 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  38.32 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  37.61 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  39.05 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  33.62 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  34.23 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.41 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  32.52 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  34.23 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  35.9 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  37.25 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  36.36 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  35.29 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  40.38 
 
 		 411 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0249  hypothetical protein  32.23 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  33.61 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  36.7 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  33.63 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>