More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1550 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  96.2 
 
 
184 aa  357  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  50.28 
 
 
187 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  40.98 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  48.23 
 
 
180 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  45 
 
 
166 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  42.34 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  41.3 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  41.61 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  38.76 
 
 
135 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  47.46 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  38.07 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  46.96 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  36.2 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  40 
 
 
183 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  39.58 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.17 
 
 
301 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2275  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2326  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.475999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  44.14 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  32.14 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  35.94 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  39.6 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.6 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  36.62 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.81 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  36.64 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.27 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  38.74 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  37.19 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  35.61 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  35.66 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  38.46 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  35.9 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  33.07 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  34.33 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  38.18 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  40.57 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  41.24 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  34.65 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  38.05 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  38.89 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  31.03 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  34.03 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  31.82 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  39.29 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  33.63 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  40.19 
 
 
411 aa  68.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  32.12 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  34.82 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  35.78 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  34.03 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  34.03 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  34.03 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  32.06 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.75 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  34.55 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  33.96 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.75 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.6 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  33.91 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  34.55 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  32.74 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  35.78 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  31.97 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.55 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  31.65 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.97 
 
 
142 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  32.84 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  35.45 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  42.59 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.58 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  36.27 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  28.66 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.71 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  35.29 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  44.32 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  39.22 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  32.76 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  38.6 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  33.64 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  32.2 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  34.96 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  35.34 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  32.76 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>