More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0254 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  45.04 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  53.1 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  45.32 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.54 
 
 
301 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  50.86 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  50.43 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  44.76 
 
 
156 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  43.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  45.19 
 
 
144 aa  103  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  46.36 
 
 
411 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  40 
 
 
155 aa  100  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  46.72 
 
 
162 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  41.67 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  39.86 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.84 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  52.63 
 
 
446 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  51.52 
 
 
193 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  46.85 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  46.09 
 
 
142 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  43.31 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.98 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  46.3 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  45.71 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  44.44 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.88 
 
 
157 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  48.04 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  39.01 
 
 
186 aa  90.9  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  40.65 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  40.29 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  44.25 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  48.42 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  38.02 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  37.98 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  38.97 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.12 
 
 
158 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  37.21 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.12 
 
 
158 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  52.69 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  37.78 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  41.59 
 
 
189 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  43.97 
 
 
155 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  36.43 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  44.44 
 
 
171 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  36.62 
 
 
160 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  40.15 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  40.52 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  47.67 
 
 
205 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  47.52 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  37.82 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40.91 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  39.5 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37.09 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  40.65 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  35.14 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  43.81 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  38.71 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  37.67 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  45.35 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.83 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  44.64 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  44.04 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  44.64 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  43.52 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  39.62 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  40.37 
 
 
169 aa  84  6e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  32.84 
 
 
195 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  39.47 
 
 
168 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  40.52 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.83 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  32.62 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  39.37 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.6 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  34.56 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  42.22 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  34.93 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  41.28 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  39.39 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  35.97 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  41.74 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  40.68 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  38.1 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  30.14 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  36.81 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  32.14 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  32.14 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>