More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1438 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  58.73 
 
 
161 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  58.87 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  57.94 
 
 
161 aa  141  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  57.94 
 
 
161 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  54.92 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  55.74 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  49.59 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  50.41 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  54.47 
 
 
171 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  48.84 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  52.03 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  48.84 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  48.2 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  54.47 
 
 
171 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  52.89 
 
 
167 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  59.02 
 
 
159 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  50.39 
 
 
167 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  52.34 
 
 
195 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  54.84 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  48.76 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  48.48 
 
 
181 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  56.91 
 
 
200 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  49.18 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  51.59 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.59 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  49.18 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  53.28 
 
 
169 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  47.62 
 
 
158 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  46.72 
 
 
154 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.57 
 
 
261 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.57 
 
 
261 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  46.67 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.4 
 
 
258 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  46.72 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.6 
 
 
237 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  47.11 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  47.97 
 
 
176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  48.36 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  47.15 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  47.11 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  45.9 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  47.54 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  46.72 
 
 
154 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  46.34 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.15 
 
 
157 aa  106  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  44.63 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  45.9 
 
 
161 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.8 
 
 
258 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.8 
 
 
258 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.8 
 
 
258 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  44.27 
 
 
149 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  44.72 
 
 
154 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  45.74 
 
 
185 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  45.83 
 
 
150 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  43.85 
 
 
153 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.76 
 
 
274 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  42.86 
 
 
158 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  42.31 
 
 
157 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  45.9 
 
 
157 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  48.72 
 
 
301 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  42.31 
 
 
156 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  45.16 
 
 
205 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  44.63 
 
 
152 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
273 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  42.98 
 
 
152 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  46.09 
 
 
194 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.54 
 
 
270 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  46.83 
 
 
168 aa  100  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.62 
 
 
437 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  46.67 
 
 
160 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  46.28 
 
 
162 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  46.05 
 
 
149 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  44.72 
 
 
160 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  43.8 
 
 
152 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  44.63 
 
 
152 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  45.9 
 
 
156 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  47.11 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
171 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  46.67 
 
 
162 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  42.98 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  41.38 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  40.5 
 
 
176 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  43.8 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  42.11 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  42.19 
 
 
206 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  39.52 
 
 
202 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>