More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1181 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  326  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  91.25 
 
 
160 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  90 
 
 
172 aa  291  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.16 
 
 
160 aa  104  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  38.67 
 
 
159 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  35.76 
 
 
174 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  47.66 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  38.85 
 
 
153 aa  91.3  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.88 
 
 
154 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  46.02 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.97 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  47.54 
 
 
144 aa  88.6  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  37.6 
 
 
176 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  41.86 
 
 
180 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.67 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.16 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.04 
 
 
446 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  34.09 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  39.2 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  39.2 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  39.67 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  36.96 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.78 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  34.88 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.32 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  38.64 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  42.28 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  39.13 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  37.67 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  37.67 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  37.67 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  36.99 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  40.18 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.84 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.53 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  42.57 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  40.16 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.75 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.21 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  34.75 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  36.29 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  39.02 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  40.32 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  35.62 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  41.51 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.53 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  35.66 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  36.75 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  35.9 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  40 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  36.04 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  38.89 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  36.92 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  39.26 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  31.16 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.81 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.86 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.78 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.39 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  31.39 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  35.97 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  38.46 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  30.83 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  35.85 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  36.22 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  36.8 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  38.66 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  34.03 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  37.04 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  38.02 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  39.62 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  34.03 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  39.32 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  39.57 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  35.65 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  35.11 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.18 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  36.52 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  33.8 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  38.26 
 
 
411 aa  70.5  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  40.82 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  34.29 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  34.45 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.95 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  38.71 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  35.38 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>