More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1069 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  51.88 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  47.31 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  47.31 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  50.31 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  46.58 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  44.85 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  40.37 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  41.1 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.22 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42.24 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.51 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  43.15 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  42.96 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  37.34 
 
 		 301 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  42.25 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.37 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.22 
 
 		 142 aa  111  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.42 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.75 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40.49 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  43.9 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  39.1 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  36 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  36.49 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  46.72 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.4 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.55 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  40.85 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  32.69 
 
 		 201 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  44.59 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  31.76 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  40.41 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  39.32 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  35.58 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  39.2 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  37.86 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  36.09 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  38.21 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  38.52 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  31.01 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  34.9 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  35.77 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  38.93 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  39.67 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  37.59 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  35.26 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  35.26 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  35.26 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  42.4 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  36.75 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  36.75 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  37.61 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  32.28 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  35.25 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  37.7 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  36.43 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  39.02 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  37.1 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  36.89 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  30.49 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  34.53 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.82 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  34.03 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  30.67 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  37.4 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  36.17 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.83 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  34.71 
 
 		 195 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  35.16 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  36 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.67 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  36.52 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  35.34 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>