More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3401 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 161 aa  323  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  93.79 
 
 		 161 aa  308  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  93.79 
 
 		 161 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  76.92 
 
 		 159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  74.68 
 
 		 159 aa  200  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  72.96 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  57.94 
 
 		 147 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  51.5 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  51.39 
 
 		 190 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  47.9 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  48.37 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  50.3 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  52.32 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  51.43 
 
 		 190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  47.13 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  51.43 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  51.43 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  44.91 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  48.05 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  46.11 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  47.65 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  48.78 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  52.76 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  48.03 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  46.95 
 
 		 195 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  43.98 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  44.24 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  50.42 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  42.17 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  41.51 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  47.06 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  46.3 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  43.98 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  40.38 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  40 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.17 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  38.46 
 
 		 202 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  47.83 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  49.57 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  46.96 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  47.83 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 261 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 261 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  47.01 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  46.76 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.83 
 
 		 274 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  40.56 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.83 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  41.3 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  46.09 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.01 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  48.25 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  49.17 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  44.07 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  48.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.01 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  45.67 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  46.15 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  45.76 
 
 		 206 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  41.4 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  47.83 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  45.69 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  45.22 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  43.1 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45.22 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.15 
 
 		 258 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  38.27 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  45.83 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  49.12 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  47.41 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  47.41 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  41.25 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3283  hypothetical protein  46.71 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  41.88 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  39.02 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.3 
 
 		 258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  42.61 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3598  hypothetical protein  46.71 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  38.27 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.3 
 
 		 258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.3 
 
 		 258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  42.5 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  39.1 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  49.57 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  49.57 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  46.09 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  45.95 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>