More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3831 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  100 
 
 
170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  93.59 
 
 
157 aa  296  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  65.61 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  65.58 
 
 
187 aa  193  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  63.82 
 
 
183 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  59.62 
 
 
156 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  59.12 
 
 
160 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  59.51 
 
 
156 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  60.13 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  60.38 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  61.94 
 
 
186 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  60.26 
 
 
177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  60.26 
 
 
177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  60.26 
 
 
177 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  59.09 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  58.94 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  58.94 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  57.59 
 
 
153 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  56.6 
 
 
159 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  56.13 
 
 
173 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  55.56 
 
 
162 aa  164  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  54.14 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  57.05 
 
 
150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  55.77 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  60.26 
 
 
182 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  54.14 
 
 
153 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  55.48 
 
 
188 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  55.92 
 
 
201 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  56.77 
 
 
150 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  51.92 
 
 
151 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  51.66 
 
 
166 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  56.95 
 
 
179 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  49.01 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  49.67 
 
 
157 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  44.87 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  47.1 
 
 
182 aa  134  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  47.1 
 
 
153 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  51.68 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  40.37 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.65 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  46.21 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36.31 
 
 
446 aa  95.5  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  34.16 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  42.62 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  42.62 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.98 
 
 
156 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.8 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  43.2 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  45.45 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.48 
 
 
158 aa  90.9  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.96 
 
 
301 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  39.6 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  39.6 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  42.76 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.9 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  37.78 
 
 
159 aa  87.4  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.46 
 
 
142 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  34.87 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.53 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  39.84 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  34.3 
 
 
162 aa  85.1  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.5 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  47.17 
 
 
157 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.68 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  46.55 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.61 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  39.84 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  34 
 
 
154 aa  82  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  38.96 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  36.8 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40.35 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  42.98 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  37.93 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  43.36 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  34.45 
 
 
142 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  32.45 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  37.5 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  33.85 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  36.52 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  46.15 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  37.06 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  38.6 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  32.8 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  32.67 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  29.45 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  33.55 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  38.79 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  43.97 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  42.99 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.55 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  37.4 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  37.93 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>