More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0793 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.35 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  43.75 
 
 		 167 aa  90.9  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  48.33 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 152 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  41.8 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.8 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  44.95 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.8 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  42.98 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  36.55 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  32.76 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 301 aa  84.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  38.69 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  36.43 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  43.81 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  32.41 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  32.41 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  41.51 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  38.13 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  40.94 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.14 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  37.41 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  39.26 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  35.25 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  41.18 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  32.45 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  32.17 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  36.84 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.23 
 
 		 446 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  36.72 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  37.1 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  32.06 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  32.35 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  32.35 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  32.35 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  42.16 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  32.35 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  37.84 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  38.18 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.94 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  41.53 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.32 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  34.97 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  34.65 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  42.72 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  31.97 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  36.29 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  34.92 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.45 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  34.04 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  31.25 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  42.72 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.84 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  41.75 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  34.68 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  33.1 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  43.14 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  34.26 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  33.03 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  30.81 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.54 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  39.05 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  37.39 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  32.72 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  32.85 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  33.11 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  42.16 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  37.72 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.85 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  32.39 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  35.04 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  32.82 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  38.74 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  32.89 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>