More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1416 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  45.19 
 
 
152 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  44.66 
 
 
193 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  42.02 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.34 
 
 
301 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  42.73 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  47.54 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  43.75 
 
 
180 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  43.56 
 
 
411 aa  87.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  39.17 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  36.03 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  38.93 
 
 
162 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  38.28 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  40.5 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  44.66 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  33.11 
 
 
157 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  46.15 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  40.74 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  46.24 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  38.46 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.35 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  36.62 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  45.69 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  41.3 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  43.3 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.87 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  39.57 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  43.88 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.8 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.8 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  46.59 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  43.75 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.8 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  40.17 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.68 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.03 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  38.66 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  41.96 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  45.16 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  40.59 
 
 
114 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.07 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  35.51 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  44.83 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  45.45 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  42.68 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.07 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  47.13 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  36.7 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  38.2 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  41.58 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  33.08 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  41.28 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  38.61 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.19 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  40.35 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  39.08 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  42.22 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  36.5 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  39.66 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  32.23 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  42.71 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  41.76 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  36.52 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.7 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  38.32 
 
 
190 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  47.56 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.59 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  35.17 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36.57 
 
 
446 aa  72  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  40.43 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  31.4 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  46.43 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.14 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.33 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  38.95 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  41.11 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  34.23 
 
 
202 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  42.42 
 
 
189 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0249  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  38.14 
 
 
190 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  37.96 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  42.7 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  35.85 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  40 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>