More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2165 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  45.37 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  45.37 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  48.42 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  45.37 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  48.15 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  44.44 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  48.42 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  48.15 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  48.91 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  39.5 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  41.24 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.02 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  41.67 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  42.59 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  42.99 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  43.24 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  47.13 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  39.81 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  40.74 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  42.73 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  48.81 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  45.65 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  40.66 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  40.66 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  45 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  43.82 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  39.81 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  35.09 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  38.89 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  45.98 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  38.18 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  41.96 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  41.96 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  36.45 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  40.91 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  44.57 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  36.56 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  37.27 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  35.34 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  37.27 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  37.27 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  42.11 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.38 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  40.7 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  43.02 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.39 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  39.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  42.53 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  37.04 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  38.18 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  39.8 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  35.19 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  39.53 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  36.7 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  38.6 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  34.91 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  37.96 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  42.27 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  37.93 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  38.38 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  40.7 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  43.43 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.45 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.14 
 
 		 261 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  42.53 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.14 
 
 		 261 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  43.82 
 
 		 186 aa  67  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  40.7 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  34.26 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.59 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  36.21 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  38.3 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  44.83 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  34.78 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  35.65 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  41.86 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  35.43 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  35.43 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>