More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4096 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  75.33 
 
 		 151 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  74 
 
 		 152 aa  227  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  71.33 
 
 		 152 aa  221  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  72.67 
 
 		 152 aa  218  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  71.33 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  71.62 
 
 		 148 aa  214  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  70.67 
 
 		 152 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  64 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  66.9 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.76 
 
 		 273 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  62.82 
 
 		 437 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.76 
 
 		 270 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.09 
 
 		 270 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.09 
 
 		 270 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.09 
 
 		 270 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.09 
 
 		 270 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.09 
 
 		 270 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.33 
 
 		 261 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.33 
 
 		 261 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  67.81 
 
 		 160 aa  170  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 258 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58 
 
 		 237 aa  166  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.72 
 
 		 258 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.72 
 
 		 258 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.72 
 
 		 258 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.76 
 
 		 270 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.76 
 
 		 270 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  58.78 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.42 
 
 		 255 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  60.14 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.7 
 
 		 245 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  60.14 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  51.97 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  54.69 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  50.96 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.42 
 
 		 255 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  52.08 
 
 		 189 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  52.46 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  48.36 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.17 
 
 		 274 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  48.15 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  47.4 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  46.3 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  47.52 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  57.52 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  48.41 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  46.41 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  45.1 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  50 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  49.22 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  47.4 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  51.28 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  45.83 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  45.83 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  50.39 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.31 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  39.74 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  45.51 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  41.38 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  46.09 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  45.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  44.81 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  48.7 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  45.38 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  43.14 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  42.31 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  46.4 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  43.14 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  45.19 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  45.19 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  38.96 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  44.53 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  51.79 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  47.33 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  41.01 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  52 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  52 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  38.96 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  52.94 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  50.4 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  51.2 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  52.94 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  41.03 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  50.4 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  51.2 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  41.03 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  55.75 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>