More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3949 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  73.29 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  69.33 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  70.47 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  67.81 
 
 		 148 aa  195  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  66.22 
 
 		 152 aa  190  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  66.89 
 
 		 152 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  66.67 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  66 
 
 		 152 aa  187  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  67.81 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  60.27 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  58 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 273 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.73 
 
 		 437 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  65.77 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  64.43 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.24 
 
 		 245 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  63.76 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.05 
 
 		 258 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  63.93 
 
 		 255 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.33 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.33 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  53.79 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.46 
 
 		 258 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.46 
 
 		 258 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.46 
 
 		 258 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.1 
 
 		 261 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.1 
 
 		 261 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  46.95 
 
 		 189 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.42 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.8 
 
 		 274 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  46.54 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  48.73 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  53.02 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  46.84 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  50.65 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  48.03 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  44.3 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  58.47 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52.67 
 
 		 137 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  47.68 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  45.39 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.86 
 
 		 255 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  49.61 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  54.03 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  41.61 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  44.52 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  48.32 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  56.14 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  44.52 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  44.52 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  49.21 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  40.94 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  45.78 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  44.3 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  52.89 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  51.66 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  50 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  48.41 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  47.33 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  54.78 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  48.84 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  46.83 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  49.67 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  45.93 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  49.21 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  41.06 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  50.4 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  47.02 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  45.04 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  46.36 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  48.34 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  47.37 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  50 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  47.37 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  45.7 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  44.74 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  55.26 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  56.03 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  55.26 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  43.15 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  43.15 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>