More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4667 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  78.67 
 
 		 151 aa  244  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  76.16 
 
 		 152 aa  236  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  73.03 
 
 		 152 aa  231  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  74.17 
 
 		 152 aa  227  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  73.51 
 
 		 152 aa  225  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  72.3 
 
 		 148 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  72.67 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  65.13 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  69.33 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  64.67 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.38 
 
 		 437 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.33 
 
 		 273 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.33 
 
 		 270 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.67 
 
 		 270 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.67 
 
 		 270 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.67 
 
 		 270 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.67 
 
 		 270 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.67 
 
 		 270 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  56.16 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  60.4 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  61.07 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.42 
 
 		 237 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  60.4 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.69 
 
 		 258 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.1 
 
 		 261 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.1 
 
 		 261 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.72 
 
 		 245 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.06 
 
 		 258 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.06 
 
 		 258 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.06 
 
 		 258 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.38 
 
 		 255 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.67 
 
 		 270 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.09 
 
 		 270 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  50.62 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  54 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  48 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  54.23 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.79 
 
 		 255 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52.99 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  49.18 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  57.26 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  43.79 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  50 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  50 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  51.75 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  44.81 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  47.8 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  46.26 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  43.51 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.62 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  43.51 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.07 
 
 		 274 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  41.18 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  52.54 
 
 		 157 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  41.18 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  49.63 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  47.2 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  46.45 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  45.32 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  49.37 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  44.52 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  41.72 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  41.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  41.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  41.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  41.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  42.96 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  41.06 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  41.06 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  44.53 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  47.01 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  41.45 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  47.37 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  42.34 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  46.09 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  47.29 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  40.52 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  43.18 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  50 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  50.44 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  50 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  47.2 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  43.18 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  49.14 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  50 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  47.2 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  47.2 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  46.4 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  47.37 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  47.37 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  48.25 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  50.79 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  50 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>