More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0512 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  86.81 
 
 		 245 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.36 
 
 		 270 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.78 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.6 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.39 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.39 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.39 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.39 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.74 
 
 		 237 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.04 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.15 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.64 
 
 		 437 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.62 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.78 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.04 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.78 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.78 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.78 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.78 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  68.24 
 
 		 153 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  66.44 
 
 		 153 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.06 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  65.77 
 
 		 153 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  54.3 
 
 		 154 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  48.55 
 
 		 189 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  58.39 
 
 		 152 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  57.82 
 
 		 149 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  56.85 
 
 		 154 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  54.42 
 
 		 149 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  56.67 
 
 		 152 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  60.63 
 
 		 152 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  54.49 
 
 		 168 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  57.55 
 
 		 152 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  54.79 
 
 		 147 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  57.25 
 
 		 148 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  56.83 
 
 		 152 aa  151  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  52.94 
 
 		 158 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  53.21 
 
 		 160 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  47.17 
 
 		 157 aa  148  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.8 
 
 		 157 aa  148  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  50.64 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  51.72 
 
 		 149 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  54.81 
 
 		 154 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  53.57 
 
 		 161 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  49.63 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  52.53 
 
 		 166 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  51.09 
 
 		 157 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  48.67 
 
 		 154 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  49.63 
 
 		 153 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  49.01 
 
 		 154 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  50.69 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  48.37 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  58.5 
 
 		 160 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  49.63 
 
 		 156 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  48.61 
 
 		 161 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  48.61 
 
 		 161 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  45.91 
 
 		 160 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  50 
 
 		 159 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  50 
 
 		 159 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  50.75 
 
 		 161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  48.3 
 
 		 161 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.83 
 
 		 157 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  48.57 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  46.98 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  44.16 
 
 		 157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  51.91 
 
 		 137 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  52.26 
 
 		 164 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  52.29 
 
 		 157 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  51.66 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  49.67 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  49.67 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  46.75 
 
 		 154 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  48.08 
 
 		 166 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  49.35 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 153 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  51.92 
 
 		 157 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  52.59 
 
 		 153 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 153 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  45.26 
 
 		 158 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  42.77 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  42.77 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  48.59 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  51.61 
 
 		 157 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  49.67 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  50.74 
 
 		 155 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 153 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 		 155 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  50 
 
 		 155 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>