More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4242 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  86.09 
 
 
152 aa  266  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  85.43 
 
 
152 aa  265  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  82.78 
 
 
152 aa  259  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  76.16 
 
 
152 aa  236  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  74 
 
 
151 aa  229  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  74 
 
 
154 aa  227  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  73.65 
 
 
148 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  70.86 
 
 
154 aa  220  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  69.18 
 
 
149 aa  197  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  66.89 
 
 
160 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 
270 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.06 
 
 
273 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
270 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
270 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
270 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
270 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
270 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.39 
 
 
437 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  56.38 
 
 
149 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.08 
 
 
261 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.08 
 
 
261 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.08 
 
 
237 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.41 
 
 
258 aa  160  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  61.76 
 
 
270 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  61.76 
 
 
270 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.05 
 
 
258 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.05 
 
 
258 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.05 
 
 
258 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  58.11 
 
 
153 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  56.76 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.79 
 
 
245 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  61.48 
 
 
255 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  54.36 
 
 
147 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  48.77 
 
 
189 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  52.07 
 
 
157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.08 
 
 
255 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  53.85 
 
 
161 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  43.62 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  59.5 
 
 
274 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  53.12 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  44.87 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  52.59 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  50 
 
 
168 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  53.78 
 
 
161 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  47.1 
 
 
156 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  55.75 
 
 
154 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  50.39 
 
 
158 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  49.3 
 
 
161 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  49.3 
 
 
161 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  45.51 
 
 
161 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  44.52 
 
 
153 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  51.52 
 
 
137 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  46.15 
 
 
161 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  44.23 
 
 
159 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  51.11 
 
 
160 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  48.03 
 
 
157 aa  120  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  44.23 
 
 
159 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  43.42 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  47.06 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  45.1 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  43.59 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  50.62 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  47.13 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  43.42 
 
 
154 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  51.41 
 
 
157 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  48.25 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  44.6 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  42.95 
 
 
157 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  42.75 
 
 
155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  43.45 
 
 
158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  50.89 
 
 
157 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  51.72 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  50.78 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  53.57 
 
 
154 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  51.08 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  51.08 
 
 
157 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  49.61 
 
 
153 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  49.61 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  49.61 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  48.82 
 
 
153 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  42.96 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  45.74 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  46.22 
 
 
166 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  48.82 
 
 
153 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  48.25 
 
 
158 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  51.72 
 
 
153 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  51.16 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  51.72 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  47.44 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  52.17 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  51.72 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>