More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2925 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  77.33 
 
 		 153 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  76.82 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  74.19 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  73.86 
 
 		 158 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  73.72 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  75.17 
 
 		 153 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  74.5 
 
 		 153 aa  214  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  75.17 
 
 		 153 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  74.5 
 
 		 153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  74.5 
 
 		 153 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  73.15 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  74.5 
 
 		 153 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  73.83 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  73.83 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  70.86 
 
 		 153 aa  207  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  66.21 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  65.52 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  67.59 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  63.09 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  62.42 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  66.21 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  65.52 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  63.09 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  63.27 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  63.45 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  58.94 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  63.95 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  63.27 
 
 		 168 aa  183  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  61.9 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  65.1 
 
 		 153 aa  180  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  60.69 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  56.08 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  65.52 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  63.33 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  66.22 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  58.28 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  62.76 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  62.76 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  62.76 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  62.76 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  62.76 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  62.76 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  62.76 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  55.03 
 
 		 149 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  63.09 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  62.07 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  56.55 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  62.07 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  55.33 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  62.67 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  62 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  58 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  54.14 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  54.66 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  57.33 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  59.18 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  50.32 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  65.38 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  54.14 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  52.32 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.67 
 
 		 245 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  55.73 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  49.66 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.97 
 
 		 255 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  50.72 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  56.08 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  51.68 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  51.68 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.88 
 
 		 258 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.88 
 
 		 258 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.88 
 
 		 258 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  48.63 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.91 
 
 		 258 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.59 
 
 		 270 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  44.3 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  44.38 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.44 
 
 		 261 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.44 
 
 		 261 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.94 
 
 		 274 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.95 
 
 		 270 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.45 
 
 		 237 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  44.1 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.71 
 
 		 270 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.71 
 
 		 273 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  45.39 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.04 
 
 		 437 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>